Зав. отделением, хирург Толеубаев Еркебулан Асхатович. Отделение оказывает круглосуточную экстренную хирургическую и гинекологическую помощь населению области и центральных районов города. За год в отделении выполняется более 1600 операций. Выполняется около 60 экстренных лапароскопических операций в год. В отделении концентрируются наиболее сложные пациенты с экстренной хирургической патологией из других ЛПУ области. Сотрудники отделения оказывают постоянную консультативную и лечебную помощь по линии медицины катастроф и санитарной авиации.

 Отделение отличается многопрофильностью. Производит оказание экстренной помощи пациентам хирургической и гинекологической патологии. Применяются современные методы лечения, врачами отделения освоена методика проведения телелапороскопических операций.

В связи с объединением гинекологического отделения в 2008 году, в отделении экстренной хирургии уменьшилось количество коек до 20 и объединяет также приемный покой. 

Работа отделения происходит в постоянном контакте с работниками кафедры госпитальной хирургии. С самого основания отделения были назначены курирующие доценты: к. м. н. Дарвин В. В., доктор медицинских наук Ержанов О. М., доктор медицинских наук Мамалинов Г. К.

В настоящее время курирующим доцентом отделения является к. м. н. доцент Тургунов Е. М.  Отделение находится под постоянным контролем заместителя главного врача по хирургии д. м. н., врача высшей категории Цхай Б. В.

За последнее время в отделении внедрены: лапароскопические методы диагностики, экстренные лапороскопические операции, все виды техники оперативного вмешательства и диагностики заболевания. Проводится постоянная и регулярная работа по повышению уровня квалификации медицинского персонала.