В 1951 году происходит организация урологического отделения. На базе урологического отделения больницы организуется кафедра урологии, которую долгие годы возглавлял доцент Шибаев Г. П. и работали ассистентами Курынова Л. Н., Смирнова Зоя Яковлевна и Чукин Михаил Васильевич.
Отделение на 60 коек обслуживало урологических больных Карагандинской области и других областей Казахстана. В то время диагностические возможности были ограничены. В основном проводились рентгеноурологические исследования (обзорная, экскреторная урография и цистоскопия с катетеризацией). УЗИ и ренография до начала 1980-х годов не проводилась.
Заведующими отделением работали в разные годы Куринова Людмила Николаевна, Кривченкова Ирина Тимофеевна, к. м. н. Бровер М. В., Нильдибаев Б. А. Основным направлением работы отделения и кафедры были пластические операции при гидронефрозе и нефропексия при нефроптозе с помощью брюшины крупного рогатого скота. В отделении проводились все виды операции. В начале 80-х годов внедрены почечная ангиография, радиоизотопная ренография и сканирование почек. Многие исследования врачи считали необходимым опробовать и произвести на себе. Например, первым пациентам радиоизотопной ренографии был Нильдибаев Б. А.
После окончания клинической ординатуры, с 1978 год по апрель 1994 года отделением заведовал Б. А. Нильдибаев, а курсом урологии — доцент Троценко Ю. И., с 1993 по 1997 года — доцент Урываев Ю. М. В этот период основными направлениями урологического отделения была разработка метода ушивания ложа после аденомэктомии, пластические операции при пузырно-влагалищных свищах, пластика уретры, удаление каралловыдных конкрементов.
С 1994 по январь 2001 года заведовал отделением В. М. Соколов. Отделение функционировало на 45 коек, с 1999 года расширено на 50 коек. Зав. курсом урологии на базе госпитальной хирургии работали доцент Тунгушбаев С. С 2001 года работает к. м. н. доцент Кудеринов С. К.
С января 2001 года отделение заведует Бейсенов Куандык Турлыгулович. Коечный фонд сохранен в прежнем количестве. С 2001 года внедрены новые технологии — дистанция литотрипсия фирмы «Dorhier medtechnik» при мочекаменной болезни. С января 2002 года внедрен в работу аппарат ТУР фирмы «Karl Storz», который применяется для оперативного лечения доброкачественной гиперплазии предстательной железы. Врачебный состав урологического отделения постоянно занимается повышением своего профессионального уровня. Молодые врачи проходят обучения в различных города мира — Берлине, Москве, Бонне, Астане, Алматы. Опыт старшего поколения и наследие отделения обязывает идти вперед — изучать мировые достижения и перенимать опыт передовых клиник с последующем внедрением их у нас.
